Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HSD17B12Q53GQ0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms