Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms