Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LAMA3Q16787 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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