Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ZNF239Q16600 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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ZNF239Q16600 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF239Q16600 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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