Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLC18A3Q16572 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms