Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CNGA3Q16281 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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