Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NEDD8Q15843 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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