Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITSN1Q15811 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITSN1Q15811 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
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