Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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EFNB3Q15768 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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EFNB3Q15768 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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EFNB3Q15768 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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EFNB3Q15768 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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EFNB3Q15768 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EFNB3Q15768 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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