Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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