Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
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