Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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