Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FHL3Q13643 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FHL3Q13643 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FHL3Q13643 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FHL3Q13643 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FHL3Q13643 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FHL3Q13643 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FHL3Q13643 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FHL3Q13643 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FHL3Q13643 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FHL3Q13643 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FHL3Q13643 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FHL3Q13643 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FHL3Q13643 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FHL3Q13643 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FHL3Q13643 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FHL3Q13643 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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FHL3Q13643 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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FHL3Q13643 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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FHL3Q13643 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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FHL3Q13643 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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