Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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PEX6Q13608 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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PEX6Q13608 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PEX6Q13608 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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