Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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