Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMARCB1Q12824 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMARCB1Q12824 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMARCB1Q12824 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMARCB1Q12824 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMARCB1Q12824 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMARCB1Q12824 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMARCB1Q12824 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMARCB1Q12824 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMARCB1Q12824 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMARCB1Q12824 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SMARCB1Q12824 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SMARCB1Q12824 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SMARCB1Q12824 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SMARCB1Q12824 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SMARCB1Q12824 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SMARCB1Q12824 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMARCB1Q12824 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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