Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC173Q0VFZ6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms