Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NCBP1Q09161 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms