Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms