Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCL9Q07325 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms