Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms