Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms