Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms