Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPCQ01831 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
XPCQ01831 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPCQ01831 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPCQ01831 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPCQ01831 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPCQ01831 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
XPCQ01831 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPCQ01831 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPCQ01831 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
XPCQ01831 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPCQ01831 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPCQ01831 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPCQ01831 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
XPCQ01831 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
XPCQ01831 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
XPCQ01831 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPCQ01831 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPCQ01831 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPCQ01831 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPCQ01831 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPCQ01831 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPCQ01831 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPCQ01831 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPCQ01831 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XPCQ01831 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XPCQ01831 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XPCQ01831 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XPCQ01831 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XPCQ01831 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XPCQ01831 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XPCQ01831 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XPCQ01831 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XPCQ01831 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XPCQ01831 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XPCQ01831 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
XPCQ01831 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XPCQ01831 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XPCQ01831 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
XPCQ01831 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XPCQ01831 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
XPCQ01831 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
XPCQ01831 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
XPCQ01831 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
XPCQ01831 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
XPCQ01831 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
XPCQ01831 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
XPCQ01831 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
XPCQ01831 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
XPCQ01831 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPCQ01831 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPCQ01831 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPCQ01831 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPCQ01831 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPCQ01831 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPCQ01831 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPCQ01831 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPCQ01831 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPCQ01831 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPCQ01831 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPCQ01831 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPCQ01831 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPCQ01831 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
XPCQ01831 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPCQ01831 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPCQ01831 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPCQ01831 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPCQ01831 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPCQ01831 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPCQ01831 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
XPCQ01831 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPCQ01831 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPCQ01831 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPCQ01831 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPCQ01831 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPCQ01831 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPCQ01831 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPCQ01831 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPCQ01831 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPCQ01831 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPCQ01831 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPCQ01831 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPCQ01831 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPCQ01831 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
XPCQ01831 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPCQ01831 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPCQ01831 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
XPCQ01831 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPCQ01831 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPCQ01831 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
XPCQ01831 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPCQ01831 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPCQ01831 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPCQ01831 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPCQ01831 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPCQ01831 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPCQ01831 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPCQ01831 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPCQ01831 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPCQ01831 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms