Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRB1P82279 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRB1P82279 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRB1P82279 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRB1P82279 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRB1P82279 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRB1P82279 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRB1P82279 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRB1P82279 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CRB1P82279 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CRB1P82279 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRB1P82279 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRB1P82279 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRB1P82279 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRB1P82279 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRB1P82279 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRB1P82279 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRB1P82279 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRB1P82279 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRB1P82279 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRB1P82279 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRB1P82279 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRB1P82279 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRB1P82279 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRB1P82279 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRB1P82279 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRB1P82279 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRB1P82279 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRB1P82279 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRB1P82279 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRB1P82279 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRB1P82279 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRB1P82279 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRB1P82279 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRB1P82279 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRB1P82279 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRB1P82279 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRB1P82279 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRB1P82279 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRB1P82279 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRB1P82279 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRB1P82279 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRB1P82279 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRB1P82279 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRB1P82279 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRB1P82279 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRB1P82279 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRB1P82279 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRB1P82279 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRB1P82279 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRB1P82279 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRB1P82279 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRB1P82279 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CRB1P82279 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRB1P82279 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRB1P82279 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRB1P82279 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRB1P82279 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CRB1P82279 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRB1P82279 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRB1P82279 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRB1P82279 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRB1P82279 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRB1P82279 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRB1P82279 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRB1P82279 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRB1P82279 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRB1P82279 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRB1P82279 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRB1P82279 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRB1P82279 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRB1P82279 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRB1P82279 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRB1P82279 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRB1P82279 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRB1P82279 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRB1P82279 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRB1P82279 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRB1P82279 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRB1P82279 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRB1P82279 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRB1P82279 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRB1P82279 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRB1P82279 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRB1P82279 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRB1P82279 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRB1P82279 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRB1P82279 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRB1P82279 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRB1P82279 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRB1P82279 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRB1P82279 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRB1P82279 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRB1P82279 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CRB1P82279 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CRB1P82279 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRB1P82279 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRB1P82279 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRB1P82279 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRB1P82279 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms