Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms