Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BACE1P56817 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BACE1P56817 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BACE1P56817 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BACE1P56817 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BACE1P56817 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BACE1P56817 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BACE1P56817 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BACE1P56817 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BACE1P56817 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BACE1P56817 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BACE1P56817 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BACE1P56817 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BACE1P56817 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BACE1P56817 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BACE1P56817 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BACE1P56817 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BACE1P56817 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BACE1P56817 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BACE1P56817 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BACE1P56817 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BACE1P56817 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BACE1P56817 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BACE1P56817 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BACE1P56817 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BACE1P56817 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BACE1P56817 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BACE1P56817 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BACE1P56817 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BACE1P56817 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BACE1P56817 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BACE1P56817 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BACE1P56817 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BACE1P56817 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BACE1P56817 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BACE1P56817 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BACE1P56817 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BACE1P56817 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BACE1P56817 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BACE1P56817 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BACE1P56817 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BACE1P56817 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BACE1P56817 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BACE1P56817 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BACE1P56817 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BACE1P56817 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BACE1P56817 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BACE1P56817 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BACE1P56817 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BACE1P56817 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BACE1P56817 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
BACE1P56817 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BACE1P56817 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BACE1P56817 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BACE1P56817 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BACE1P56817 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BACE1P56817 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BACE1P56817 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BACE1P56817 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BACE1P56817 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BACE1P56817 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BACE1P56817 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BACE1P56817 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BACE1P56817 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BACE1P56817 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BACE1P56817 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BACE1P56817 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BACE1P56817 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BACE1P56817 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BACE1P56817 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BACE1P56817 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BACE1P56817 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BACE1P56817 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BACE1P56817 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BACE1P56817 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BACE1P56817 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BACE1P56817 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BACE1P56817 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BACE1P56817 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BACE1P56817 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BACE1P56817 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BACE1P56817 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BACE1P56817 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BACE1P56817 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BACE1P56817 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BACE1P56817 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BACE1P56817 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BACE1P56817 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BACE1P56817 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BACE1P56817 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms