Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTCP1P56278 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms