Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSWP56202 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSWP56202 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTSWP56202 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTSWP56202 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CTSWP56202 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTSWP56202 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSWP56202 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSWP56202 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSWP56202 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSWP56202 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSWP56202 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSWP56202 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSWP56202 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSWP56202 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSWP56202 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSWP56202 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSWP56202 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSWP56202 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSWP56202 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSWP56202 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSWP56202 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSWP56202 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSWP56202 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSWP56202 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSWP56202 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSWP56202 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSWP56202 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSWP56202 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSWP56202 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSWP56202 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSWP56202 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSWP56202 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSWP56202 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSWP56202 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSWP56202 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSWP56202 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSWP56202 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSWP56202 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSWP56202 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSWP56202 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSWP56202 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSWP56202 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSWP56202 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSWP56202 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSWP56202 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSWP56202 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSWP56202 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSWP56202 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSWP56202 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSWP56202 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSWP56202 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSWP56202 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSWP56202 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSWP56202 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSWP56202 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSWP56202 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSWP56202 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSWP56202 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSWP56202 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSWP56202 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSWP56202 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSWP56202 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSWP56202 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSWP56202 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSWP56202 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSWP56202 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSWP56202 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSWP56202 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSWP56202 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSWP56202 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSWP56202 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSWP56202 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSWP56202 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSWP56202 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSWP56202 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSWP56202 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSWP56202 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSWP56202 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSWP56202 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSWP56202 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSWP56202 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSWP56202 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSWP56202 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSWP56202 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSWP56202 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSWP56202 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSWP56202 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSWP56202 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSWP56202 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSWP56202 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSWP56202 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSWP56202 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSWP56202 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSWP56202 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSWP56202 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSWP56202 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSWP56202 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSWP56202 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSWP56202 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms