Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP12AP54707 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms