Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPAP53621 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPAP53621 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPAP53621 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPAP53621 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPAP53621 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPAP53621 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPAP53621 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPAP53621 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPAP53621 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPAP53621 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPAP53621 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPAP53621 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPAP53621 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPAP53621 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPAP53621 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPAP53621 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPAP53621 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPAP53621 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPAP53621 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPAP53621 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPAP53621 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPAP53621 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPAP53621 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPAP53621 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPAP53621 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPAP53621 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPAP53621 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPAP53621 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPAP53621 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPAP53621 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPAP53621 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPAP53621 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPAP53621 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPAP53621 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPAP53621 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPAP53621 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPAP53621 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPAP53621 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPAP53621 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPAP53621 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms