Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KCNQ1P51787 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNQ1P51787 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNQ1P51787 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNQ1P51787 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNQ1P51787 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNQ1P51787 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNQ1P51787 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNQ1P51787 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNQ1P51787 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNQ1P51787 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNQ1P51787 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNQ1P51787 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNQ1P51787 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNQ1P51787 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNQ1P51787 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNQ1P51787 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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