Protein–RNA interactions for Protein: P51151

RAB9A, Ras-related protein Rab-9A, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9AP51151 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms