Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GRIA4P48058 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms