Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHKA1P46020 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms