Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRATP43155 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRATP43155 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRATP43155 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRATP43155 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRATP43155 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRATP43155 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRATP43155 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRATP43155 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRATP43155 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRATP43155 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRATP43155 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRATP43155 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRATP43155 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CRATP43155 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRATP43155 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms