Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC1P33527 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC1P33527 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms