Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG3P32926 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG3P32926 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG3P32926 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG3P32926 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG3P32926 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG3P32926 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG3P32926 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG3P32926 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG3P32926 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG3P32926 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG3P32926 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG3P32926 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG3P32926 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG3P32926 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG3P32926 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG3P32926 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG3P32926 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG3P32926 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG3P32926 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSG3P32926 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSG3P32926 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSG3P32926 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG3P32926 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG3P32926 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG3P32926 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG3P32926 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG3P32926 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG3P32926 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG3P32926 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG3P32926 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG3P32926 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG3P32926 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG3P32926 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG3P32926 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG3P32926 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG3P32926 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG3P32926 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG3P32926 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG3P32926 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG3P32926 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSG3P32926 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms