Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KDM5AP29375 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms