Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNTFRP26992 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms