Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YY1P25490 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YY1P25490 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YY1P25490 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YY1P25490 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YY1P25490 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YY1P25490 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YY1P25490 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YY1P25490 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YY1P25490 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YY1P25490 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YY1P25490 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YY1P25490 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
YY1P25490 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YY1P25490 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
YY1P25490 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YY1P25490 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YY1P25490 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YY1P25490 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YY1P25490 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YY1P25490 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YY1P25490 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YY1P25490 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YY1P25490 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
YY1P25490 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
YY1P25490 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YY1P25490 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YY1P25490 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YY1P25490 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YY1P25490 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YY1P25490 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YY1P25490 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YY1P25490 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YY1P25490 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
YY1P25490 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YY1P25490 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YY1P25490 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YY1P25490 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
YY1P25490 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YY1P25490 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YY1P25490 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YY1P25490 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YY1P25490 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YY1P25490 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YY1P25490 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YY1P25490 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YY1P25490 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YY1P25490 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YY1P25490 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YY1P25490 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YY1P25490 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YY1P25490 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YY1P25490 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YY1P25490 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YY1P25490 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
YY1P25490 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
YY1P25490 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
YY1P25490 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YY1P25490 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YY1P25490 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YY1P25490 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YY1P25490 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YY1P25490 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YY1P25490 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
YY1P25490 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YY1P25490 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YY1P25490 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YY1P25490 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YY1P25490 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YY1P25490 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YY1P25490 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YY1P25490 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YY1P25490 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YY1P25490 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YY1P25490 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YY1P25490 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YY1P25490 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YY1P25490 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YY1P25490 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YY1P25490 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
YY1P25490 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YY1P25490 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YY1P25490 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YY1P25490 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YY1P25490 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YY1P25490 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YY1P25490 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YY1P25490 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YY1P25490 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YY1P25490 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YY1P25490 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YY1P25490 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YY1P25490 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YY1P25490 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YY1P25490 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YY1P25490 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YY1P25490 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YY1P25490 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YY1P25490 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YY1P25490 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms