Protein–RNA interactions for Protein: P24941

CDK2, Cyclin-dependent kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2P24941 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK2P24941 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK2P24941 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDK2P24941 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDK2P24941 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDK2P24941 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK2P24941 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2P24941 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2P24941 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2P24941 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2P24941 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2P24941 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2P24941 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2P24941 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2P24941 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2P24941 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2P24941 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2P24941 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2P24941 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2P24941 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2P24941 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2P24941 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2P24941 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2P24941 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2P24941 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2P24941 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2P24941 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2P24941 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2P24941 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK2P24941 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK2P24941 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK2P24941 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK2P24941 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK2P24941 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK2P24941 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK2P24941 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK2P24941 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK2P24941 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK2P24941 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK2P24941 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK2P24941 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK2P24941 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms