Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms