Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRGP23470 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms