Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP4AP20648 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP4AP20648 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms