Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms