Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC3P19447 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC3P19447 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms