Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPI1P17947 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPI1P17947 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPI1P17947 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms