Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGB4P16144 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms