Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP3P12645 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP3P12645 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP3P12645 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP3P12645 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP3P12645 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP3P12645 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP3P12645 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP3P12645 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP3P12645 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP3P12645 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP3P12645 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP3P12645 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP3P12645 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP3P12645 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP3P12645 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP3P12645 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP3P12645 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP3P12645 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP3P12645 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP3P12645 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP3P12645 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP3P12645 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP3P12645 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP3P12645 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP3P12645 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP3P12645 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP3P12645 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP3P12645 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP3P12645 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP3P12645 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP3P12645 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP3P12645 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP3P12645 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP3P12645 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BMP3P12645 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BMP3P12645 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BMP3P12645 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BMP3P12645 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BMP3P12645 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BMP3P12645 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BMP3P12645 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BMP3P12645 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BMP3P12645 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BMP3P12645 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BMP3P12645 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BMP3P12645 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BMP3P12645 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BMP3P12645 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BMP3P12645 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BMP3P12645 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BMP3P12645 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BMP3P12645 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BMP3P12645 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BMP3P12645 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BMP3P12645 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BMP3P12645 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BMP3P12645 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BMP3P12645 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BMP3P12645 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BMP3P12645 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BMP3P12645 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BMP3P12645 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BMP3P12645 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BMP3P12645 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BMP3P12645 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BMP3P12645 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BMP3P12645 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BMP3P12645 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BMP3P12645 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BMP3P12645 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BMP3P12645 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BMP3P12645 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BMP3P12645 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BMP3P12645 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BMP3P12645 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BMP3P12645 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BMP3P12645 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BMP3P12645 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
BMP3P12645 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
BMP3P12645 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
BMP3P12645 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BMP3P12645 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BMP3P12645 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BMP3P12645 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BMP3P12645 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BMP3P12645 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BMP3P12645 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BMP3P12645 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BMP3P12645 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP3P12645 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP3P12645 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP3P12645 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP3P12645 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP3P12645 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP3P12645 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BMP3P12645 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP3P12645 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BMP3P12645 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BMP3P12645 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms